Allora lascia perdere la guida che è anche vecchia

1) Apri megui
2) Tool avisynt script creator
3) imput video e carica il video mp4
4) Passa alla finestra filter e alla voce subtilte carcica il file ass
5) Passa alla finestra script e clicca su preview se vuoi controllare il risultato altrimenti salva direttamente
6) adesso non devi far altro che scegliere i codec e configurarli a tuo piacimento
edit
Mi sono dimenticato che dopo devi riencodare anche l'audio ed infine muxarlo con il tool
ho fatto una prova veloce con un file da 22 minuti, tempo necessario per una discreta qualità con un pc decente <20 minuti